Python使用SimpleITK与OpenCV读取CT医学图像并提取切片

阿麦
阿麦
发布时间:2026-10-13| 6人浏览过
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本文详解如何使用Python的SimpleITK库读取CT医学图像(MHD格式),并通过OpenCV将三维数据序列保存为单幅PNG图片。代码展示了从读取文件、获取数组形状到逐帧写入的具体实现,适用于医学影像预处理场景。

执行该操作前,需确保环境中已安装OpenCV和SimpleITK这两个依赖库。

SimpleITK的安装方式较为简便,直接通过pip install SimpleITk命令即可完成安装。

具体的实现代码如下:

#coding:utf-8
import SimpleITK as sitk
import cv2
 
#LKDS-00058,-102.655469971,108.188810974,438.759994507,12.2279986879
if __name__ == '__main__':
  filename = "F:/cancer_solution/data/train_subset00/LKDS-00058.mhd"
  ds = sitk.ReadImage(filename)
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds)
  frame_num, width, height = img_array.shape
 
  outpath = "F:/cancer_solution/out/train/LKDS-00058"
  index = -1
  for img_item in img_array:
    index = index + 1
    cv2.imwrite("%s/%d.png"%(outpath,index),img_item)
 
  print "done!"

运行上述代码后,即可将CT影像数据解析并导出为多个单幅图片文件。

目前对于(x,y,z)三维坐标与图像切片之间的具体对应关系尚不完全清楚。

祈愿世间无病痛,何愁架上药生尘。相信癌症终有一天能被彻底战胜。

以上关于Python读取CT医学图像的实例详解内容到此结束,希望能为读者提供参考,并欢迎大家继续支持本站。

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