Python 读取 .gz 压缩文件及字节串转换详解

Evan

发布时间：2026-10-16| 3人浏览过

原创

本文详细介绍在Python中读取.gz压缩文件的方法。通过引入gzip和os模块，演示了单文件与批量文件的读取流程，重点解析了字节串（bytes）与字符串（str）之间的相互转换技巧，并提供了处理fastq.gz格式文件的实际代码示例，帮助开发者高效处理压缩数据。

Python 读取 .gz 文件

在 Python 中读取 .gz 文件，必须使用内置的 gzip 模块。如果环境中未预装该模块，需先在终端执行安装命令进行补充。

pip install gzip

import gzip
path = "" #你的文件路径
f = gzip.open(path, 'rb')
 
for line in f.readlines(): # 按行进行读取
    s = line.decode() # 读取之后要进行解码
    print(s) # s 为string类型，就是我们读取的文件中的一行

除了单文件读取，还可以利用 os 模块实现对文件夹内所有 .gz 文件的批量读取操作。

import gzip
import os\
 
path = "" #表示你要打开的文件夹
files = os.listdir(path) #files 是path中存放的所有文件名集合
for file in files:
    f = gzip.open(path+file, 'rb')
    for line in f.readline():
        print(line)

Python 处理 gz 文件时，常涉及字符串与字节串的相互转换。

首先介绍将字节串（bytes）转换为字符串（str）的方法：

b = b'some byte array'
 
str(b, encoding = "utf-8")  
#or
bytes.decode(b)

接着介绍将字符串（str）转换为字节串（bytes）的方法：

s = 'some string'
 
bytes(s, encoding = "utf8")  
#or
str.encode(s)

以下是针对 fastq.gz 格式文件的读取示例。

with gzip.open(fq,'r') as fastq:
    try:
        while True:
            line1 = next(fastq).decode()  # 字节转字符串
            line2 = next(fastq).decode()
            line3 = next(fastq).decode()
            line4 = next(fastq).decode()
            
    except:
            pass

以上为个人经验总结，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持本站。